A continuació es detallen les malalties o complicacions més importants a les quals poden contribuir les infeccions pel virus Coxsackie:
Malalties endocrines, nutricionals i metabòliques (E00-E90).
- Diabetis mellitus tipus 1
- Tiroiditis (inflamació de la glàndula tiroide)
Pell i subcutània (L00-L99)
- Onicodistròfia adquirida (creixement patològic de les ungles) de les ungles dels peus grans amb onicomadesi (despreniment proximal de la placa ungueal del llit de les ungles) i leuconíquia (taques blanques a les ungles) secundària a la febre aftosa de la mà de Coxsackie A6 (complicació tardana) )
Sistema cardiovascular (I00-I99).
- Miocarditis (inflamació del cor múscul).
- Pericarditis (inflamació del pericardi)
Psique: sistema nerviós (F00-F99; G00-G99)
- Meningitis (meningitis).
- Meningoencefalitis (combinat inflamació del cervell (encefalitis) I meninges (meningitis)).
- Paràlisi