Els isoflavonoides tenen una estructura molecular similar a l’estrogen esteroide (hormona sexual femenina) i, per tant, també s’anomenen fitoestrògens. No obstant això, la seva activitat hormonal és menor en un factor de 100 a 1,000 en comparació amb l'estrogen format en l'organisme dels mamífers. Per la seva semblança químic-estructural amb el sexe femení les hormones, isoflavones ingerit amb aliments es pot unir a l’anomenat receptor d’estrògens de tipus 2 i bloquejar-lo per obtenir estrògens endògens. D'acord amb, isoflavones en dones postmenopàusiques amb baixos nivells d’estrògens endògens presenten un efecte més estrogènic, mentre que les isoflavones en dones premenopàusiques tenen un efecte antiestrogènic bloquejant els receptors d’estrògens.
