Mutacions del coronavirus

Les mutacions són normals

L'aparició de noves variants virals no és gens inusual: els virus, inclòs el patogen Sars-CoV-2, canvien repetidament el seu material genètic a l'atzar durant la replicació. La majoria d'aquestes mutacions no tenen sentit. Alguns, però, són avantatjoses per al virus i s'estableixen.

D'aquesta manera, els virus són capaços d'adaptar-se ràpidament a l'entorn i al seu hoste. Això forma part de la seva estratègia evolutiva.

L'OMS classifica les noves variants segons les següents categories:

  • Variants en vigilància (VBM): Variants amb canvis genètics que podrien suposar un risc més elevat, però amb efectes que encara no estan clars.
  • Variant d'interès (VOI): variants que tenen característiques genètiques que són predictives d'una transmissibilitat més alta, que no superen les proves d'immunitat o diagnòstic, o una malaltia més greu en comparació amb les formes anteriors.
  • Variant d'alta conseqüència (VOHC) – Variant d'alta conseqüència: Variant contra la qual les vacunes actuals no ofereixen protecció. Fins ara, no hi ha hagut cap variant del SARS-CoV-2 en aquesta categoria.

Les variacions de virus s'agrupen en els anomenats clades o llinatges; així, els investigadors registren i documenten sistemàticament l'"arbre genealògic del coronavirus". Cada variant es caracteritza segons les seves propietats hereditàries i se li assigna una combinació lletra-número. Tanmateix, aquesta designació no indica si una soca concreta del virus és més perillosa que una altra.

Com canvia el coronavirus?

Hi ha dues maneres perquè el coronavirus evolucioni “amb èxit”: canvia de tal manera que pot entrar millor a la cèl·lula humana, fent-se així més infecciosa, o intenta “escapar” del nostre sistema immunitari adaptant-se:

Mutació d'escapament: són canvis que permeten al coronavirus "escapar" del sistema immunitari. Aleshores, el virus canvia la seva forma externa de tal manera que els anticossos (ja formats) d'una infecció o vacunació inicial són ara menys capaços de "reconèixer-lo" i neutralitzar-lo. Això també es coneix com a "mutacions d'escapament" o "escapada immune". Així, les segones infeccions podrien ser més probables.

Com es desenvolupen les variants del virus?

Com més dura la pandèmia, més infeccions, més variacions i mutacions del coronavirus.

La pandèmia de Corona ha estat en curs des de fa dos bons anys: a partir del 05 de gener de 2022, el Johns Hopkins Coronavirus Resource Center (CRC) ara informa d'uns 296 milions de casos d'infecció a tot el món.

Oportunitat suficient perquè el coronavirus acumuli múltiples canvis (variacions) en el material genètic.

Aquest enorme nombre de casos, i els canvis genètics que l'acompanyen en el Sars-CoV-2, es reflecteixen en la propagació ara extensa d'un gran nombre de noves variants de virus:

Delta: el llinatge B.1.617.2

La variant delta (B.1.617.2) del Sars-CoV-2 també es va estendre ràpidament a Alemanya en els últims mesos (tardor del 2021). Va ser descobert per primera vegada a l'Índia i es divideix en tres subvariants que combinen diversos canvis característics.

D'una banda, es tracta de canvis en la proteïna espiga, que es considera la "clau" de la cèl·lula humana. D'altra banda, B.1.617 també presenta canvis que es discuteixen com una (possible) mutació d'escapament.

Concretament, B.1.617 combina, entre d'altres, les mutacions rellevants següents:

Mutació D614G: pot fer que el coronavirus sigui més contagiós. El modelatge inicial suggereix que això fa que B.1.617 es transmeti almenys tan fàcilment com la variant alfa altament contagiosa (B.1.1.7).

Mutació P681R: també associada pels investigadors amb possiblement un augment de la virulència.

Mutació E484K: També s'ha trobat en la variant beta (B.1.351) i la variant gamma (P.1). Se sospita que fa que el virus sigui menys sensible als anticossos neutralitzants ja formats.

Mutació L452R: també es parla com una possible mutació d'escapament. Les soques de coronavirus amb la mutació L452R eren parcialment resistents a certs anticossos en experiments de laboratori.

La variant delta, que fins ara ha estat predominant a Europa, també sembla desplaçada en grans esglaons per la variant omicron molt contagiosa.

Omikron: el llinatge B.1.1.529

La variant d'Omikron és la mutació del coronavirus més recent, descoberta per primera vegada a Botswana el novembre de 2021. Ara està classificada oficialment com una nova variant de preocupació per l'Organització Mundial de la Salut (OMS).

Eris: El llinatge EG.5

La variant EG.5 del coronavirus és del llinatge Omikron. Es va detectar per primera vegada el febrer del 2023. Des d'aleshores, s'ha anat estenent per diversos països del món i dominant l'escena de la infecció a molts llocs. També s'anomena Eris, després de la deessa grega de la discòrdia i la lluita.

EG.5 descendeix de les variants omicron XBB.1.9.2. i XBB.1.5, però també té una nova mutació a la proteïna espiga (F456L). La sublínia EG.5.1 també porta una altra mutació Q52H.

És EG.5 més perillós que les variants anteriors?

Amb l'aparició de l'EG.5, torna a augmentar el nombre de casos d'infecció per corona i, amb ell, les hospitalitzacions. Fins ara, segons l'OMS, no s'han informat canvis en la gravetat de la malaltia. Per tant, l'OMS ha classificat EG.5 com a variant d'interès (VOI), però no com a variant de preocupació (VOC).

Les vacunes de reforç coincidents per a la tardor no estan dirigides precisament a EG.5, sinó a un llinatge viral estretament relacionat (XBB.1.5). Els primers estudis clínics indiquen que la vacunació de reforç també és efectiva contra EG.5.

Pirola: El llinatge BA.2.86

La variant del virus BA.2.86 també és un derivat d'omicron. Es diferencia de la seva putativa variant predecessora BA.2 per 34 noves mutacions a la proteïna espiga, la qual cosa la fa igualment divergent de les formes anteriors com Omicron va ser més recentment.

Què tan comú és BA.2.86?

Fins ara, la variant només s'ha trobat en poques persones. Tanmateix, ara es fan poques proves en general. En particular, les proves elaborades que determinen la variant viral particular són rares. El fet que els casos coneguts provinguin de tres continents (Amèrica del Nord, Àsia i Europa) i no estiguin relacionats directament fa pensar que Pirola ja s'ha estès desapercebut.

BA.2.86 és més perillós que les variants anteriors?

Són efectives les vacunes adaptades contra BA.2.86?

Les vacunes disponibles a partir de setembre estan optimitzades per a la variant XBB.1.5. La seva proteïna espiga difereix de la de Pirola en 36 seccions. Per tant, és probable que es redueixi la protecció contra la infecció. No obstant això, els experts creuen que la protecció contra cursos greus encara es manté.

Altres variants de virus conegudes

També s'han desenvolupat variants addicionals del virus Sars-CoV-2 que difereixen del tipus salvatge, però els experts actualment no les classifiquen com a COV. Aquestes soques de virus s'anomenen "Variants d'interès" (VOI).

Encara no està clar quin impacte podrien tenir aquests VOI emergents sobre la pandèmia. Si s'afirmen i prevalguin contra les soques de virus que ja circulen, també es podrien actualitzar als COV corresponents.

Variants d'especial interès

  • BA.4: Subtipus Omicron, descobert per primera vegada a Sud-àfrica.
  • BA.5: Subtipus Omicron, descobert per primera vegada a Sud-àfrica.

Variants en seguiment

Les anomenades "Variants sota control" (VUM) es troben en el focus estès, però encara hi ha una manca de dades fiables i sistemàtiques sobre aquestes. En la majoria dels casos, només es disposa de proves de la seva mera existència. Inclouen variants esporàdiques, així com descendents "modificats" de mutacions ja conegudes.

Segons l'ECDC, aquests VUM rars inclouen actualment:

  • XD: variant detectada per primera vegada a França.
  • BA.3 – subtipus de la variant Omikron, detectat per primera vegada a Sud-àfrica.
  • BA.2 + L245X – subtipus de la variant omicron d'origen desconegut.

Variants de virus degradades

Tan dinàmicament com els esdeveniments d'infecció en la pandèmia de Corona en curs estan evolucionant, també ho és la comprensió científica i l'avaluació de les variants del virus predominant en les diferents fases de la pandèmia.

Alfa: el llinatge B.1.1.7

La variant alfa del coronavirus (B.1.1.7) amb prou feines circula per Europa, segons els funcionaris. Alpha es va detectar per primera vegada al Regne Unit i, començant al sud-est d'Anglaterra, s'ha estès cada cop més pel continent europeu des de la tardor del 2020.

El llinatge B 1.1.7 va tenir un nombre sorprenentment elevat d'alteracions gèniques, amb 17 mutacions. Diverses d'aquestes mutacions van afectar la proteïna de l'espiga, inclosa molt significativament la mutació N501Y.

Es creu que B.1.1.7 va ser aproximadament un 35 per cent més contagiós que el Sars-CoV-2 de tipus salvatge, i també es va augmentar la taxa de mortalitat observada per infecció (sense vacunació prèvia). No obstant això, les vacunes disponibles van conferir una protecció robusta.

Alpha està disminuint fortament d'acord amb les agències oficials (ECDC, CDC i OMS).

Beta: el llinatge B.1.351

El mutant probablement es va desenvolupar com a resultat d'una alta infestació de la població sud-africana amb el virus. Sud-àfrica ja va registrar brots de corona a gran escala els mesos d'estiu del 2020. Als municipis en particular, el virus probablement va trobar les condicions ideals per propagar-se a passos de gegant.

Això vol dir que moltes persones ja eren immunes a la forma original de Sars-CoV-2: el virus havia de canviar. Els investigadors es refereixen a aquesta situació com a pressió evolutiva. Com a resultat, es va imposar una nova variant del virus que era superior a la forma original perquè, entre altres coses, és més contagiosa.

Les dades preliminars suggereixen que la vacuna Comirnaty també té una alta eficàcia contra el llinatge B.1351. VaxZevria, d'altra banda, pot tenir una eficàcia reduïda, segons una declaració preliminar dels autors Madhi et al.

La beta està en fort descens d'acord amb les agències oficials (ECDC, CDC i OMS).

Gamma: La línia P.1

Un altre COV anomenat P.1, abans conegut com B.1.1.28.1, ara anomenat Gamma, es va descobrir per primera vegada al Brasil el desembre de 2020. P.1 també té la important mutació N501Y al seu genoma. Així, la soca del virus P.1 es considera altament contagiosa.

Gamma originàriament va evolucionar i es va estendre a la regió amazònica. La propagació de la variant coincideix amb l'augment de les hospitalitzacions relacionades amb la Covid-19 en aquesta regió a mitjans de desembre de 2020.

La gamma està disminuint bruscament d'acord amb experts de l'ECDC, CDC i OMS.

Més variants desescalades

Tot i que ara s'han conegut un gran nombre de noves variants de virus, això no significava automàticament una amenaça més gran. La influència d'aquestes variants en la incidència de la infecció (global) va ser petita o es van suprimir. Això inclou:

  • Epsilon: B.1.427 i B.1.429, descobert per primera vegada a Califòrnia.
  • Eta: detectat a molts països (B.1.525).
  • Theta: abans designat P.3, ara rebaixat, descobert per primera vegada a les Filipines.
  • Kappa: detectat per primera vegada a l'Índia (B.1.617.1).
  • Lambda: descoberta per primera vegada al Perú el desembre de 2020 (C.37).
  • Mu: descobert per primera vegada a Colòmbia el gener de 2021 (B.1.621).
  • Iota: descobert per primera vegada als EUA a l'àrea metropolitana de Nova York (B.1.526).
  • Zeta: abans designat P.2, ara rebaixat, descobert per primera vegada al Brasil.

Amb quina rapidesa muta Sars-CoV-2?

En el futur, el Sars-CoV-2 continuarà adaptant-se al sistema immunitari humà i a una població (parcialment) vacunada mitjançant mutacions. La rapidesa amb què això passa depèn en gran mesura de la mida de la població activament infectada.

Com més casos d'infecció hi hagi -regional, nacional i internacional-, més es multiplica el coronavirus, i amb més freqüència es produeixen mutacions.

En comparació amb altres virus, però, el coronavirus muta relativament lentament. Amb una longitud total del genoma Sars-CoV-2 d'uns 30,000 parells de bases, els experts assumeixen una o dues mutacions al mes. En comparació, els virus de la grip (grip) muten entre dues i quatre vegades més sovint en el mateix període.

Com puc protegir-me de les mutacions del coronavirus?

No podeu protegir-vos específicament de mutacions individuals de coronavirus: l'única possibilitat és no infectar-vos.

Com es detecten les mutacions del coronavirus?

Alemanya té un sistema d'informes de malla estreta per controlar els virus Sars-CoV-2 circulants: s'anomena "sistema de vigilància molecular integrat". Amb aquesta finalitat, les autoritats sanitàries pertinents, l'Institut Robert Koch (RKI) i els laboratoris de diagnòstic especialitzats col·laboren estretament.

Com funciona el sistema de notificació en cas de sospita de mutacions?

En primer lloc, cada prova positiva de coronavirus realitzada professionalment està subjecta a un informe obligatori al departament de salut pública corresponent. Això inclou les proves de coronavirus realitzades en un centre de proves, al consultori del vostre metge, a la vostra farmàcia o fins i tot a instal·lacions governamentals, com ara escoles. No obstant això, les autotests privades estan excloses d'això.

Per obtenir més informació sobre les proves ràpides de coronavirus per a l'autoprova, consulteu el nostre tema especial sobre l'autoprova de Corona.

A continuació, el RKI compara les dades informades i el resultat de l'anàlisi de la seqüència en forma pseudònima. Pseudònim significa que no és possible treure conclusions sobre una persona individual. Tanmateix, aquesta informació constitueix la base de dades perquè els científics i els actors del sistema sanitari obtinguin una visió general precisa de la situació pandèmica existent. Això permet la millor avaluació possible de la situació per tal de derivar mesures polítiques (si cal).

Què és una anàlisi de seqüenciació del genoma?

Una anàlisi del genoma de seqüenciació és una anàlisi genètica detallada. Examina la seqüència exacta dels blocs de construcció d'ARN individuals dins del genoma viral. Això significa que el genoma Sars-CoV-2, que comprèn uns 30,000 parells de bases, està descodificat i després es pot comparar amb el del coronavirus de tipus salvatge.

Només d'aquesta manera es poden identificar les mutacions individuals a nivell molecular, i és possible una assignació dins de l'"arbre genealògic del coronavirus".

Això també deixa clar que no tots els països del món són capaços de fer un seguiment detallat de la propagació exacta de variants específiques de coronavirus. Per tant, és probable que hi hagi certa incertesa en les dades d'informes disponibles.