Hi ha nombrosos enfermetats infeccioses que pot ser causat per pneumococ. Els principals són:
Sistema respiratori (J00-J99)
- Pneumònia (pneumònia)
- Rinosinusitis - inflamació del nas i sinus.
- sinusitis (inflamació del sinus paranasals).
- Traqueobronquitis: inflamació de la tràquea i dels bronquis.
Ulls i apèndixs oculars (H00-H59).
- Ulcer serpens corneae (úlcera corneal).
Sistema cardiovascular (I00-I99)
- Endocarditis (inflamació de la paret interna del cor).
- Pericarditis (inflamació del pericardi)
boca, esòfag (esòfag), estómaci intestins (K00-K67; K90-K93).
- Apendicitis (“Apendicitis”).
- Peritonitis ("inflamació del peritoneu")
Orelles: procés mastoide (H60-H95)
- Mastoïditis (inflamació del procés mastoide).
- Otitis mitjana (inflamació de l’orella mitjana)
Psique: sistema nerviós (F00-F99; G00-G99)
Sistema genitourinari (ronyons, tracte urinari - òrgans reproductors) (N00-N99).
Diferencialment, també es poden considerar altres infeccions bacterianes i víriques:
- Patògens bacterians
- Chlamydia
- Haemophilus influenzae
- Moraxella catarrhalis
- Mycoplasma
- Patògens vírics
- Adenovirus
- Coronavirus humans (OC43, 229E)
- Virus gripals
- Paramixovirus (virus W. RS)
- Picornavirus (esp. Rinovirus).