A causa del diagnòstic clínic definit i del curs lleu, diagnòstic de laboratori no són obligatoris en la majoria dels casos.
Paràmetres de laboratori de primer ordre: proves de laboratori obligatòries.
- Detecció de virus per enterovirus PCR (5’-NCR) a partir de mostres de femta, hisopos de gola o contingut de vesícules: des de les femtes, la detecció de patògens té èxit en les primeres 1-2 setmanes de la malaltia en aproximadament el 80% dels casos.
- Si cal, més diagnòstics per a la tipificació molecular: PCR a la regió VP1 que codifica proteïnes amb seqüenciació posterior.
Paràmetres de laboratori de 2n ordre - segons els resultats de la història, examen físic, etc. - per aclarir el diagnòstic diferencial.
- LCR punxada (col·lecció de líquid cefaloraquidi per punció del canal espinal) per al diagnòstic del LCR - en simptomatologia del SNC.